研究报告

蓖麻 GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析  

代梦媛 , 高梅 , 李文昌*
云南省农业科学院经济作物研究所,昆明, 650205
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年06月08日    接受日期: 2020年06月22日    发表日期: 2021年12月21日
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摘要

GRF是植物特有的转录因子,主要参与调控植物生长发育过程。本研究利用生物信息方法对蓖麻GRF (RcGRF)基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统发育、组织表达分析以及外源赤霉素(GA)和多效唑(PAC)处理两个蓖麻品种(高杆‘滇蓖 2号’和矮杆‘滇蓖 5号’)后顶端嫩茎转录组测序分析。结果表明,蓖麻共有 9GRF转录因子,蛋白长度 233~617 aa,等电点(pI)6.34~9.48,每个成员含有 2~4个内含子,每个 RcGRF的蛋白结构域均包括一个由 39~43个氨基酸组成的 WRC保守结构域和一个由 34个氨基酸组成 QLQ保守结构域。系统发育分析表明蓖麻与拟南芥 GRF的亲缘关系比水稻更近。不同组织表达结果表明多数RcGRF 基因在发育的胚乳及萌发的种子中高表达,而RcGRF2 在叶片、雄花和萌发的种子中都不表达。GAPAC处理转录组测序结果显示 GA处理DB2 RcGRF1DB2 RcGRF17 下调表达,GA处理DB5 RcGRF1DB5 RcGRF4 下调表达,PAC处理DB2 RcGRF4DB2 RcGRF6 上调表达、RcGRF9 下调表达,表明RcGRF1RcGRF4RcGRF7RcGRF9 可能通过赤霉素途径调节植物株型。本研究为蓖麻GRF 基因对生长发育调控机理研究奠定分子基础,为调控蓖麻株高相关基因的研究提供科学依据。

关键词
蓖麻;RF转录因子;生物信息学;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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